PyMOL is a molecular graphics system with an embedded Python
interpreter designed for real-time visualization and rapid generation of
high-quality molecular graphics images and animations. It can also perform many
other valuable tasks (such as editing PDB files) to assist you in your
research.
Dengan menggunakan aplikasi ini kita akan dengan mudah
mengetahui bentuk molekul, Van der Walls radius, hingga
mesh yang dimiliki oleh suatu molekul.
Berikut cara mudahnya :
Pertama kita harus membuka aplikasinya, akan muncul 2 tampilan
yaitu Molecular Graphic System dan Pymol Viewer.
Klik
toolbar build pada Molecular Graphic System , akan muncul banyak pilihan,
missal kita pilih fitur Residue → Alanine.
kemudian apabila anda ingin mengubah-ubah tampilnnya kita bisa memilih
fitur-fitur yang ada di sebelah kanan, untuk mengetahui formal charge kita bisa
pilih fitur L-toolbar → other properties →formal charge
jika ingin mengetahui Van der Walls radius tinggal pilih
L-toolbar → vdw radius
untuk mengetahui symbols pilih L-toolbar → element
symbol
Lalu pilih S-toolbar → dots
Dan kemudian jika ingin mengetahui mesh dan
surface pilih S-toolbar→ mesh dan S-toolbar → surface
Selanjutnya view dan kemudian Orient
Mudah bukannnn?? Selamat Mencoba ...
Terima Kasih sobat :)
0 komentar:
Posting Komentar